分子診斷領(lǐng)域:步入快速成長(zhǎng)期
作者:醫(yī)藥網(wǎng) 來源:醫(yī)藥網(wǎng) 2019-7-12 打印內(nèi)容
基因測(cè)序
1975年誕生的基因測(cè)序技術(shù)為人們從基因水平上篩查疾病、診斷病因奠定了技術(shù)基礎(chǔ)。幾十年來,基因檢測(cè)技術(shù)不斷提高,21世紀(jì)初,以羅氏公司(Roche)的454技術(shù)、Illumina公司的Solexa和Hiseq技術(shù)以及ABI公司的SOLiD技術(shù)為標(biāo)記的第二代測(cè)序技術(shù)誕生。第二代測(cè)序技術(shù)大大降低了測(cè)序成本,大幅度提高了測(cè)序速度,并且保持了高準(zhǔn)確性。在此之前,完成一個(gè)人類基因組的測(cè)序需要3年時(shí)間,而使用第二代測(cè)序技術(shù)則僅僅需要1周,F(xiàn)在,基因測(cè)序的成本已經(jīng)進(jìn)一步降低,2014年人類基因組測(cè)序成本降至1000美元以下。隨著Illumina公司NovaSeq系列測(cè)序儀的推出,預(yù)計(jì)人類基因組測(cè)序成本有望進(jìn)一步降低至約100美元。
第三、四代測(cè)序技術(shù)相對(duì)于第二代測(cè)序技術(shù)而言,在讀長(zhǎng)和測(cè)序速度方面具有較大優(yōu)勢(shì),在通量和準(zhǔn)確度上則存在不足。
目前,基因測(cè)序被大規(guī)模應(yīng)用于臨床診療,尤其是癌癥、產(chǎn)前診斷和遺傳病領(lǐng)域。據(jù)華大基因招股說明書數(shù)據(jù),近幾年來全球基因測(cè)序市場(chǎng)飛速發(fā)展,從2007年的7.94億美元增長(zhǎng)到2015年的59億美元,預(yù)計(jì)未來幾年依舊會(huì)保持快速增長(zhǎng),2020年將達(dá)到138億美元,年復(fù)合增長(zhǎng)率為18.7%。
全球最大的測(cè)序儀廠商為美國(guó)的Illumina公司。2017年Illumina公司收入27.52億美元,占全球基因測(cè)序儀80%以上的市場(chǎng)份額。該公司的HiSeq 2000是目前市場(chǎng)上最主流的測(cè)序儀。2018年,Illumina公司以約12億美元收購(gòu)了太平洋生物科學(xué)公司(Pacific Biosciences),將PacBio的長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序技術(shù)與其自身的高通量、短讀長(zhǎng)測(cè)序平臺(tái)相結(jié)合,形成了一家獨(dú)大的局面。
據(jù)預(yù)測(cè),有望成為第四代測(cè)序技術(shù)的是納米孔(Nanopore)測(cè)序技術(shù)。該技術(shù)具有長(zhǎng)讀長(zhǎng)、實(shí)時(shí)、小型化等特點(diǎn)。不過,目前PacBio及Oxford Nanopore測(cè)序技術(shù)的準(zhǔn)確度還待進(jìn)一步提高。
液體活檢
液體活檢是指利用人體體液作為標(biāo)本來源檢測(cè)獲取腫瘤相關(guān)信息的技術(shù)。相比傳統(tǒng)侵入式組織活檢,液體活檢具有依從性佳、標(biāo)本易獲取、特異性好等優(yōu)勢(shì)。更重要的是,其能有效克服腫瘤異質(zhì)性,可有效實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)的腫瘤輔助診斷、實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)、療效評(píng)價(jià)及預(yù)后判斷。因此,液體活檢有望成為癌癥早期輔助診斷、伴隨診斷、治療監(jiān)測(cè)及預(yù)后評(píng)估的理想技術(shù)。液體活檢主要包括循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)、循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)和外泌體等檢測(cè),其中ctDNA與CTC是目前最受關(guān)注的兩類液體活檢靶標(biāo)。ctDNA是指人體血液循環(huán)中攜帶有腫瘤特異性基因突變、缺失、插入、重排、拷貝數(shù)變異及甲基化等信息的DNA片段,主要來源于壞死或凋亡的腫瘤細(xì)胞、循環(huán)腫瘤細(xì)胞或者腫瘤細(xì)胞分泌的外泌體。CTC是指自發(fā)或被動(dòng)地從實(shí)體腫瘤病灶脫落進(jìn)入血液循環(huán)的腫瘤細(xì)胞。作為腫瘤轉(zhuǎn)移/復(fù)發(fā)的“種子”,CTC攜帶有大量與腫瘤發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移以及耐藥相關(guān)的信息。
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